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Il n'y a pas d'exigence en la matière.

L'auto-entrepreneur peut :

 acheter ses livres comptables (livre de recettes / registre des achats) en librairie,
 ou se procurer un logiciel comptable spécial,
 ou créer lui-même ses registres en utilisant un tableur.

 Voir le modèle fourni par ministère en charge des PME
 Voir une sélection de logiciels et services en ligne à destination des auto-entrepreneurs

Rappel : le registre des achats n'est à remplir que par les personnes qui relèvent du seuil de 80 000 euros (qui passera à 80 300 euros au 1er janvier 2010).